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研究揭示了剪接体内部各组成部分的独特调控功能，发现剪接体的核心蛋白不是被动而是主动参与决策，确定遗传信息如何被处理，进而影响到蛋白质的多样性。例如，有的剪接体负责识别要删除的RNA片段，有的则确保在正确的位置进行切割，还有一些则起到保护作用，防止其他组件提前行动干扰未完成的工作。
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牛世山在北京大学读硕士时的研究方向就是商周考古，1993年7月毕业分配到中国社会科学院考古研究所时，导师李伯谦对他的要求是田野考古与学术研究齐头并进。2018年，在各级文物主管部门的推动下，殷墟保护范围内原则上不再批准基建项目，学术目标明确的主动性考古成为主流。2020年殷墟王陵区考古工作重启，牛世山担任领队。
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