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重新开放后，北疆博物院还着手对文献资料进行保护，组建图书、地图等古籍资料保护团队，对北疆博物院馆藏1.4万余册图书及900余张地图资料进行保护。近期，该馆完成了馆藏所有图书、地图以及各类印版文献资料的扫描、复制等数字化工作，确保对原始文献、古籍、图纸、照片等资料的有效保护。
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