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目前，我国虽然已经掌握了冰下湖清洁钻探取样的部分关键技术，但麒麟冰下湖科学钻探工程仍面临诸多挑战。孙友宏强调，一个南极工作季，麒麟冰下湖钻探工程的有效工作时间仅为40—50天，对无污染取样要求又极为严格，加上相关技术和装备多为国际上首次在南极大深度冰盖钻探中使用，如遇上南极环境恶劣，将使得钻探作业难上加难。
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这些问题至今没有答案。但讲解员也讲了学术讨论会上学者的争辩和她自己的思考，讲以前有争议的学术问题后来是如何一步步解决。至于已经有定论的问题，早就放映在藏品旁边的屏幕上：用CT给青铜器照X光，会发现青铜器的“腿儿”里面灌了陶土。
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