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目前，我国虽然已经掌握了冰下湖清洁钻探取样的部分关键技术，但麒麟冰下湖科学钻探工程仍面临诸多挑战。孙友宏强调，一个南极工作季，麒麟冰下湖钻探工程的有效工作时间仅为40—50天，对无污染取样要求又极为严格，加上相关技术和装备多为国际上首次在南极大深度冰盖钻探中使用，如遇上南极环境恶劣，将使得钻探作业难上加难。
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