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用于重排基因组中长DNA序列的可编程系统，是基因组设计领域的有用工具。大规模基因组重排通常由重组酶（催化DNA断裂和重组）或转座酶（将DNA片段从一个位置移动到另一位置）来完成。如果这些酶可通过编程靶向特定位点，就可能成为有效的基因组编辑工具。
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