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此次考古发掘发现了明清时期的城墙基址及其配套道路、排水道等设施，同时出土了大量建筑构件及生活器物，共计小件360件、各类器物残片90箱。其中，最重要的发现是位于遗址西部和北部的“一号城墙基址”，墙体宽约7.6米，清理长度约100米，整体保存状况较好。考古专家结合地层关系、建筑材料及文献记载，综合判断该段城墙为明代南海卫城墙，始建于明洪武十七年（1384年），由南海卫指挥使常懿兴建，明清两代多次修缮和改建。
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在国家自然科学基金等项目的支持下，科研团队综合利用多种测序技术，在原有基因组基础上重新组装、完善，发布了首个对叶榕所有染色体端粒到端粒完整无间隙的基因组。该基因组大小371.8兆，所有序列均挂载到14条染色体上，成功注释了26642个编码蛋白基因，经评估，基因组的完整度、连续性和准确性均得到了大幅提升。
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