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不只地上文物，三峡水库区消落区及水下文物测绘，也为“四普”提出了挑战。由于泥沙淤积、水下环境复杂等因素，仅靠传统的全站仪定点定位，很难得到这些文物的精准数据。重庆市万州区因地制宜，在普查实践中摸索出“底数资料结合数字测绘成果”“人工打点结合低空摄影测量”“数字正射影像结合地理信息系统”“外业调查结合内业录入”的“四个结合”工作法。
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