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在动物遗存上，目前已鉴定出5纲38种。除部分家猪外，其余均为野生动物，表明当时的先民以渔猎为主，饲养家畜为辅。在植物遗存上，地层中水稻壳和芡实壳堆积大面积分布，依据现有鉴定结果和统计数据初步分析，草堰港遗址出土的水稻遗存为栽培稻，稻米和穗轴都表现出明确的驯化稻特点。
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