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团队发现，即使基因完全相同的细胞也会产生不同的模式。最初这一点让人十分困惑，但随后他们意识到，细胞密度正是造成模式差异的原因之一。当细胞密度超过某个阈值时，“synNotch”功能就会被削弱，从而影响模式的一致性。此外，随着细胞增殖，细胞密度与“synNotch”遗传回路之间也存在复杂的交互作用。
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然而，随着深度学习技术的发展，为从头设计蛋白质提供了可能，尤其是对于那些拥有复杂活性位点的蛋白质，如丝氨酸水解酶——这是已知最大的一类酶家族之一。贝克团队此次引入了一种名为PLACER（蛋白质—配体原子构象集合再现）的新型机器学习网络，该网络通过分析蛋白质骨架、氨基酸特性和结合分子的化学结构，来预测酶活性位点的精确原子排列。
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