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他曾邀请一位北京医生来给另一种罕见病的患者义诊，那位医生质疑他研究罕见病的意义：“如果我们对特定的群体抱有偏好，对其他患者是不公平的。”但义诊结束后，这位医生改变了看法，在飞机上就开始画病程发展图表，后来不断和熊志奇交流对该病的研究。回去后，医生向医院争取到3天时间，给患有这一疾病的孩子免费做全面检查。

　　　　此前，孔庆鹏团队在女性长寿老人的表观遗传特征研究中取得了显著成果。他们发现DNA甲基化这一重要的表观遗传修饰机制，与衰老及老年病的发生密切相关。研究团队不仅在女性长寿老人中揭示了基因组异染色质区域高甲基化与启动子区域低甲基化熵等表观遗传特征，还指出DNA甲基化在男性和女性衰老过程中的非同步变化，这对理解男女寿命预期及老年病发生差异具有重要意义。