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“虽然优势众多、前景广阔，但作为新兴技术，靶向蛋白降解技术现阶段仍面临几个‘坎’。”鲁伯埙表示，不同技术所面临的挑战也不尽相同。总体来讲，在临床方面，口服药物的成药性还有待提高，可能带来新的耐药性和副作用等问题，需进一步研究解决；在基础研究方面，理性设计方法需逐步建立，具体的降解机制也需进一步解构。
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吉林大学极地科学与工程研究院院长帕维尔·达拉拉伊指出，此前，俄罗斯主要采用深冰芯钻探技术，但如果要获取冰下湖湖水样品，其钻进效率较低，且所使用的钻井液极易污染冰下湖湖水样品，这大大降低了其科学研究价值。美国采用的清洁热水钻虽然避免使用钻井液，但钻进过程中冰面与冰下湖通过热水钻孔连通，如果钻进工艺控制不好，孔内热水易涌入冰下湖，导致冰下湖引入污染源，破坏封闭冰下湖原有的生态平衡。
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