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在南楼二楼的一处展柜内，陈列着4件貌不惊人的藏品，这便是“北京人”头盖骨化石模型，北疆博物院镇馆之宝之一。1929年12月2日，青年科学工作者裴文中在周口店第一地点发现了第一颗完整的“北京人”头盖骨，为“北京人”的存在提供了科学实证。1936年，在贾兰坡的主持下，又连续发现了3颗“北京人”头盖骨，再次震惊世界。文物专家介绍，北疆博物院馆藏的“北京人”头盖骨化石模型，是当年最早的一批直接从原标本复制而成的模型，由于仿真度高，在“北京人”化石原件丢失之后，就显得弥足珍贵，备受瞩目。除此之外，还有中国第一批有科学记录的旧石器——甘肃庆阳出土的石核及石片、中国第一件有科学记录的古人类化石——内蒙古萨拉乌苏出土的“河套人牙”。北疆博物院的科考发现开创了中国古哺乳动物学、旧石器时代考古学和古人类学研究的先河，也奠定了北疆博物院独一无二的社会地位和影响力。

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