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孙林峰团队利用冷冻电镜技术解析了ABCB19蛋白的高分辨率三维结构。ABCB19蛋白长得像一个可以双开口的V形夹,是细胞膜上一个个游动着的小“隧道”,倒V字开口“捕捉”细胞内部的油菜素内酯,结合后再以正V字开口在细胞外部打开进行“释放”。
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蛋白质设计的核心挑战之一是从氨基酸序列预测蛋白质的三维结构及其功能。由于蛋白质的氨基酸组成极其复杂,即使是微小变化也会导致成千上万种不同的可能性。因此,传统实验方法难以高效完成。鉴于此,团队结合了大型语言模型(LLM)和超级计算机的强大算力。
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