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研究结果表明，单倍型A是洪河遗址家犬的主要母系单倍型，其中大多数A型家犬显示出与东北亚地区以及太平洋诸岛的家犬相似的遗传关系，并与其他地区中国古代样本距离较远，而个别样本与美洲及俄罗斯远东地区古代家犬距离较近，可能暗示着两者之间存在一定联系。此外，洪河遗址还发现了B型、C型两个欧洲家犬的主要单倍型。
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“这是我国首次对水下千米级深度古代沉船遗址开展系统、科学的考古调查、记录与研究工作。”国家文物局考古研究中心研究员宋建忠介绍，这得益于多种深海技术和装备在该遗址深海考古调查中的首次应用。如三维激光扫描仪和高清相机完成了沉船遗址分布区域的全景摄影拼接和三维激光扫描；潜水器柔性机械手提取文物，采集了大量海底沉积物、底层海水、海洋生物等样品；采用载人潜水器和无人潜水器结合作业的形式，探索深海考古调查的路径和模式。
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