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博物院内的基本陈列展览主题是“良渚是实证中华五千多年文明史的圣地”，依托“水乡泽国”“文明圣地”“玉魂国魄”3个展厅，重点展出良渚文化玉器、石器、陶器和漆木器等各类珍贵文物，全面、立体、真实地展示了良渚遗址和良渚文化的考古成果、遗产价值，体现了良渚文明在中华文明“多元一体”历史发展进程中的重要地位和独特贡献。
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