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据介绍，20世纪70年代以来，随着长江流域一系列稻作遗存的发现，学界提出了水稻起源于长江中下游的观点，而其背后的早期社会面貌却知之甚少。下汤遗址贯穿新石器时代始终，经历了从稻作农业起源到新石器晚期农业高度发达的整个历程，新发现的聚落要素、聚落结构，为研究我国早期稻作农业社会提供了重要样本。
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该研究组装了稻属13个近乎完美的野生稻种基因组，并结合已公开的普通野生稻、亚洲栽培稻和非洲栽培稻基因组，构建了包含101723个基因家族的稻属超级泛基因组。其中，稻属共有的核心基因家族仅占9.84%，共鉴定到63881个栽培稻中尚未发现的新基因家族，使可利用的水稻基因扩大了1.7倍。同时，基于高质量的基因组图谱，团队首次在基因组水平重构了稻属的进化关系。
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