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“虽然优势众多、前景广阔，但作为新兴技术，靶向蛋白降解技术现阶段仍面临几个‘坎’。”鲁伯埙表示，不同技术所面临的挑战也不尽相同。总体来讲，在临床方面，口服药物的成药性还有待提高，可能带来新的耐药性和副作用等问题，需进一步研究解决；在基础研究方面，理性设计方法需逐步建立，具体的降解机制也需进一步解构。
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另外值得一提的是，有网友曾于2024年11月在国务院发展研究中心官网留言称，贵中心何以容许阮晓东一个“已离职”且未获“研究员”职称的人一直顶着“国务院”和贵中心的帽子到处沽名牟利呢？建议贵中心公开声明，施加压力。
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