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考古发掘通过多学科合作研究揭示出更多的细节。据介绍，下汤遗址植物遗存的分析结果显示：下汤遗址整个新石器时代利用的主要植物资源为水稻，果实是重要的补充性资源。在杂草组合方面，莎草科在上山至河姆渡阶段占据着主导地位，到了好川时期藜属的大量出现才改变这一格局。“这或许暗示了作物种植策略的某种变化。而相关分析则显示，上山阶段就已达到了较高的驯化率。”仲召兵说。
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为了绘制该图谱，研究人员采用了一种尖端测序方法，即单核甲基化测序和染色质构象捕获技术，能同时分析控制单个细胞基因表达的两个表观遗传机制。搞清这两个调控机制如何作用于影响发育的基因，是理解这一过程出错而导致神经和精神疾病的关键步骤。
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