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通过检查细胞核内基因的区室化，团队能够识别出猛犸象皮肤细胞内活跃和不活跃的基因——这是表观遗传学或转录组学的代表。猛犸象的皮肤细胞与其近亲亚洲象的皮肤细胞相比，具有不同的基因激活模式，这可能包括与其体毛和耐寒性相关的基因。
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2005年到清华大学工作，薛其坤瞄准长期困扰物理学界的难题——高温超导。这一探索就是8个年头。2012年，他带领团队发现了单层铁硒与钛酸锶衬底结合而产生的界面高温超导。该发现挑战主流共识，增进了科学界对超导材料的认识，国际超导界开展大量追踪研究。这是高温超导领域，我国科学家开辟的全新研究方向。
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