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此次,奥地利维也纳医科大学、瑞典哥德堡大学研究团队用一种方法,在人类胚胎面部发育期间搜索“增强子”——调控基因表达的DNA区域。随后他们交叉比对了这些增强子和一个已知有助于解释人类面部特征差异的基因列表。一些增强子与mTORC1通路的关联基因有关,这一通路控制细胞对营养的响应过程。在小鼠和斑马鱼早期胚胎发育中激活这些通路会导致面部特征变大和鼻软骨增厚。然而抑制该通路会导致斑马鱼面部变长,小鼠吻部细长。与低蛋白饮食的怀孕小鼠胚胎相比,高蛋白饮食的怀孕小鼠胚胎的mTORC1信号传导发生了改变,且鼻囊和下颌骨变大。
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ChromoGen模型能有效地捕捉序列—结构关系,为每段DNA序列生成多种可能的结构。这是因为DNA是一种非常无序的分子,同一个DNA序列可以产生许多不同的构象。这种方法不仅大大加速了三维基因组结构的预测过程,也为深入研究基因组的三维组织如何影响细胞的基因表达模式和功能提供了有力工具。
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