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在应用方面，2023年5月，《Nature》发布的论文介绍了基于迁移学习的深度学习模型Geneformer。该模型在约3000万个单细胞转录组数据上进行了预训练，旨在解决数据有限情况下的基因网络预测问题。在心肌病患者的有限数据集上，模型识别出候选治疗靶点 , 并在ipsc疾病模型中验证了其有效性。
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中国科学院分子细胞科学卓越创新中心 中国科学院院士 林其谁：35岁到45岁以上的年纪算大了，一般是做中午12点到晚上12点的班，我们年纪轻的做晚上12点到中午12点的班。这样合成工作可以连续化进行，而且同时开展不同方法技术的摸索。
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