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他和同事们制定科学规划。通过构建深潭、浅滩，连通水系，恢复湿地植被等一系列举措，野鸭湖湿地已成为北京地区面积最大、湿地类型最多、生物多样性最为丰富的湿地自然保护区。“从1997年建立野鸭湖湿地自然保护区，到禁牧禁渔、涵养生息，再到鸟儿飞回、万鸟齐飞，跻身国际重要湿地，26年来，野鸭湖湿地经历了化茧成蝶般的巨变。万顷碧波在城市中流淌，片片湿地送来盎然生机，在西山永定河文化带诗意地栖居，正在一步步从梦想变为现实。”王凤斌说。
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2014年，周口店遗址新博物馆建成，新馆展陈运用更多现代科技手段，生动还原远古人类生活环境、捕猎、采摘、制作石器、用火等场景，让观众更直观地了解古人类是如何繁衍生息，荣获第十二届全国博物馆十大陈列展览精品奖。同时，老博物馆被改造为科普体验馆，开发了多点触控、VR远古幻境、回到石器时代等近20种体感互动项目，制作了动画片《龙骨山探秘》、4D影片《北京人》《山顶洞人》，让观众有更丰富的参观体验。
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