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研究团队还将古老奶酪中开菲尔乳酸菌基因组与现代开菲尔乳酸菌基因组进行了对比，发现了一些功能性的改变。“我们认为，这些改变除了菌株本身的适应性演化外，也是人类长时间对微生物具偏好性驯化的结果。”付巧妹说。
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研究人员采用两种大肠杆菌菌株作为模型系统，通过实验证明了噬菌体捕食在微生物生长过程中并没有减少微生物数量，而且通过减缓菌株间的空间分离，促进了细胞间的紧密接触。这种紧密接触直接提升了接合作用介导的质粒转移效率，使得抗生素抗性基因得以在微生物群落中更广泛地传播。
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