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此外，海洋也是一个巨大的微生物库。徐建国提到，过去科学家们很少关注深海微生物，现在对这一领域的研究已经逐步深入。他说：“最近，我国科学家在南极的标本中就发现了16万余种新的RNA病毒，而我们现在研究的病毒种类只有1万多种。这说明我们周围存在着巨量的未知微生物，可能会影响我们的生活。”有些微生物可能是有益的，比如可以作为药品帮助人类治病；而有些微生物则可能随着海洋生物的流动传播到其他地方，引发新的传染病。
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嫦娥六号搭载的4台国际科学载荷，此行也收获颇丰。其中法国氡气探测仪传回科学数据158M，欧空局月表负离子分析仪传回科学数据3.9M，这两个项目都进入了后期数据处理和论文发表的准备阶段；意大利激光角反射器相当于在月球上“钉了一枚钉子”，有利于今后在月球开展任务时标定位置。
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