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博物院内的基本陈列展览主题是“良渚是实证中华五千多年文明史的圣地”，依托“水乡泽国”“文明圣地”“玉魂国魄”3个展厅，重点展出良渚文化玉器、石器、陶器和漆木器等各类珍贵文物，全面、立体、真实地展示了良渚遗址和良渚文化的考古成果、遗产价值，体现了良渚文明在中华文明“多元一体”历史发展进程中的重要地位和独特贡献。

　　　　微生物与人类的相互作用贯穿了人类数百万年的演化历史，数以亿计的微生物与人类共生，参与人类体内营养的合成与毒素的分解，在人类健康及其与环境的高度互动中扮演了重要角色。有评论认为，这项研究通过前所未有的古分子证据，揭开过去人群对微生物的应用驯化和传播交流历史，从分子机制层面厘清相关菌株的引入、传播和演变历程，为深入理解相关人群技术文化的交流和发展，与环境高度动态的相互作用提供了全新思路和独特维度。